明史研究室的前身为1954年成立的中国科学院历史研究所二所明清史研究组,组长为白寿彝、副组长王毓铨。1978年中国社会科学院成立后独立建室。1994年与清史研究室合并为明清史研究室。2002年重新独立建室。
自1978年建室以来,王毓铨、刘重日、张显清、万明先后任主任;明清史合室期间,林金树、万明先后任副主任。现任主任张兆裕,副主任陈时龙。本室现有成员6人,其中研究员4人,副研究员1人,助理研究员1人。
本室主要研究方向为明史。自1980年以来,本室研究成果丰硕,已出版各类专著40余部部、论文数百篇。其中《中国通史·明时期》《中国经济通史·明代经济卷》《明代政治史》《晚明社会变迁:问题与研究》《明代山东海防研究》《明代的科举与经学》《中国边疆史论》等专著为国家社科基金项目。王玉欣、周绍泉主编《徽州千年契约文书》(40卷)和王毓铨的论文《论明朝的配户当差制》获得中国社会科学院第一届优秀成果奖,栾成显《明代黄册研究》获得院第三届优秀成果奖,万明的论文《明代中葡两国的第一次正式交往》获院第四届优秀成果奖,周绍泉的论文《透过明初徽州的一桩讼案窥探三个家庭的内部结构及其相互关系》获院第五届优秀成果奖。万明主编《晚明社会变迁:问题与研究》获院第七届优秀成果奖。
自20世纪80年代以后本室主持编辑不定期丛刊《明史研究论丛》(已出版16辑)和古籍整理丛刊《明史资料丛刊》(已出版4辑)。先后编辑了《中国近八十年明史论著目录》、《百年明史研究论著目录》。2010年与天一阁合作,整理出版《天一阁藏明代政书珍本丛刊》54种、22册。目前承担的主要科研任务有中国社会科学院创新工程“明代中后期历史进程”、“中华思想通史·明代卷”等。